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1988年，被特招进了兰州军区战斗歌舞团担任相声演员，为西北的官兵和人民演出了500多场次，并立三等功一次。
1991年，走进了甘肃省电视台，担任甘肃省文艺演出活动主持，随后主持综艺节目《花好月圆》。1993年，主持中央电视台文艺节目《东西南北中》，随后主持中央电视台音乐栏目《中国音乐电视》。
1997年起，朱军开始主持中央电视台春节联欢晚会；同年，其主持、编辑的音乐节目《乡风乡韵》获得金天线电视节目大赛音乐类节目第一名。1999年，在全国金话筒节目主持人评选中获银奖第一名。
2000年12月22日，开始主持中央电视台谈话节目《艺术人生》。2001年，参加中央电视台元宵晚会，与尹相杰搭档表演相声《灯谜》。2002年，参加中央电视台春节联欢晚会，与曹颖、雪村合作表演小品《回家》；同年，获得第三届“全国百家电视艺术工作者”称号。2003年，获得第21届中国电视金鹰奖最佳节目主持人奖。
2004年，在中央电视台春节联欢晚会上与冯巩、周涛、李志强、刘金山合作表演小品《让一让，生活真美好》；同年与董卿搭档主持中央电视台音乐频道开播庆典音乐会；随后主持中央电视台音乐频道的音乐家故事讲述节目《音乐人生》；与周涛、施翌、张泽群主持在灿烂阳光下“心连心”艺术团“五一”赴浙江温州慰问演出。
2005年，在中央电视台春节联欢晚会上与冯巩表演小品《笑谈人生》；同年9月19日，与董卿、蓝心湄、胡倍蔚、刘中志一同主持“天涯共此时”——中央电视台中秋晚会。
2006年，与冯巩、牛莉搭档在央视春晚上表演小品《跟着媳妇当保姆》；同年与董卿、刘芳菲、张泽群共同主持中央电视台春节歌舞晚会；7月15日，主持央视三套互动类竞技性节目《想挑战吗》；7月16日，出任第三届中新歌会主持人；12月31日，与董卿搭档主持中央电视台诗歌朗诵节目《新年新诗会》。
2007年1月25日，与董卿、康辉主持“万家灯火平安夜——公安部春节晚会”；2月，主持“百花迎春——中国文学艺术界春节大联欢”；8月8日，与杨澜主持北京奥运会倒计时一周年庆祝活动文艺晚会；9月23日，与董卿、梁洪主持首届亚洲青年艺术节开幕式；12月31日，主持CCTV综艺盛典，同时与张泽群、毕福剑、杨柳、任鲁豫一同表演相声《五官争功》。
2008年4月，与董卿、春妮、白岩松、杨澜主持奥运倒计时100天庆祝活动暨奥运歌曲评选活动颁奖晚会；7月29日，与董卿、张泽群、朱迅共同主持“百年圆梦——迎2008北京奥运会文艺晚会”；12月31日，与周涛搭档主持中央电视台诗歌朗诵节目《新年新诗会》。
2009年9月28日，主持“《祖国万岁》——庆祝中华人民共和国成立60周年文艺晚会”；10月1日，受邀在天安门西观礼台观看国庆六十周年阅兵式，并与董卿搭档解说“首都各界庆祝中华人民共和国成立六十周年文艺晚会”。10月16日，与董卿搭档解说中华人民共和国第十一届运动会开幕式。
2010年10月31日，与曹可凡、陈蓉、董卿共同主持上海世博会闭幕式文艺晚会；11月12日，与搭档董卿解说第十六届广州亚运会开幕式及亚运会序曲珠江巡游；11月27日，与搭档董卿解说第十六届广州亚运会闭幕式；12月21日，与李瑞英、康辉、董卿主持中央电视台跨年盛典。
2011年2月2日晚，担任中央电视台兔年春节联欢晚会主持，与朱迅、周涛、董卿、李咏、张泽群合作；2月17日，担任中央电视台元宵晚会主持；10月1日，与董卿主持《五星红旗我为你骄傲》——庆祝中华人民共和国成立62周年专题文艺晚会；12月31日，与董卿、周涛、张泽群共同主持《启航2012——中央电视台元旦晚会》。
2012年1月22日晚，担任中央电视台龙年春节联欢晚会主持，与董卿、李思思、李咏、撒贝宁、毕福剑合作；2月6日晚，担任中央电视台元宵晚会主持，与董卿、李思思、李咏、撒贝宁、毕福剑合作。
2013年2月9日晚，担任中央电视台蛇年春节联欢晚会主持，与董卿、李思思、李咏、撒贝宁、毕福剑合作；6月15日，担任第三届兰州国际马拉松赛解说嘉宾，与CCTV5主持人杨建合作。
2014年1月30日，与张国立、董卿、毕福剑、李思思一同主持中央电视台马年春节联欢晚会；2月14日，与董卿、毕福剑、李思思共同担任中央电视台元宵晚会主持人；10月10日，与何炅、谢娜、汪涵一同主持第十届中国金鹰电视艺术节开幕式文艺晚会。
2015年2月2日，央视春晚官方发布确认朱军担任中央电视台羊年春节联欢晚会主持，与董卿、康辉、李思思、撒贝宁、毕福剑、朱迅、尼格买提合作；5月9日晚，与尼格买提联袂主持中央电视台平民选秀节目《星光大道》；12月31日，与董卿等多位主持人一同主持跨年直播节目《启航2016》。
2016年2月7日晚，担任中央电视台猴年春节联欢晚会主持，与周涛、董卿、撒贝宁、李思思、尼格买提合作；2月22日晚，担任中央电视台元宵晚会主持，与周涛、董卿、撒贝宁、李思思、尼格买提合作；4月29日，与朱迅搭档主持央视综艺频道推出的音乐竞技类节目《星光大道超级版》；6月26日，朱军通过个人微博发声，证实自己离开《星光大道》节目，由朱迅接棒；7月，主持中央电视台综艺频道“夏季综艺周”特别节目《人生课堂》；7月18日，与董卿主持中央电视台民歌竞技类节目《中国民歌大会》。
2017年1月27日晚，担任中央电视台鸡年春节联欢晚会主会场主持，与董卿、康辉、朱迅和尼格买提合作；2月11日，主持中央电视台元宵晚会，同时在晚会中与高晓攀、尤宪超表演相声《都是为你好》；4月，参加北京卫视少儿成长音乐节目《音乐大师课》第三季，在节目中担任“老师团”成员；12月，加盟综艺频道互动综艺节目《我要上春晚》，与张凯丽、林永健、王伟忠一同担任评委。
2018年1月5日，与张蕾搭档主持《光辉时刻——哈尔滨王立平作品交响音乐会》；同年，出任人文艺术类节目《信·中国》的主持人、制作人和总导演；1月22日，与颜丹晨主持央视综艺频道推出的春节特别节目《东西南北贺新春》；4月，为《信中国》同名主题曲作词并参与演唱。
朱军的妻子叫谭梅，是1987年从西安特招入伍的舞蹈演员。1993年5月，朱军与谭梅正式结婚。
2002年6月26日，朱军的儿子朱思潭出生。
2003年11月22日，担当“法律援助在中国”公益活动的形象大使。
2005年7月23日，担任第十届中华全国青年联合会常务委。
2014年，担任中央电视台书画家协会副会长和中国文联电视艺术家协会诗书画学会副会长。
2016年，任中国文学艺术界联合会第十届全委会委员。
2008年5月18日，主持《爱的奉献》2008年宣传文化系统抗震救灾募捐活动；7月7日，作为兰州末棒火炬手在兰州水车博览园点燃圣火盆，并为陇南地震灾区捐款20万人民币。
2010年4月20日，主持《情系玉树大爱无疆》抗震救灾晚会；6月26日，参加“众基金”&华中科大EMBA内蒙班慈善晚宴，并为活动创作了国画《极目远眺》；8月14日，主持《风雨同舟情系舟曲》赈灾晚会。
2011年5月11日，主持纪念汶川特大地震三周年专题文艺晚会。
2017年1月30日，在海南三亚参加“艺术筑桥，公益践行”公益活动，并拿出画作现场拍卖募集50万元全部捐赠给三亚光明连接脑残疾儿童康复的事业。
2014年5月，在中国国家美术馆举办个人绘画展，在福州、兰州、西安等地进行巡展。
2015年4月17日至22日，朱军携自己的80幅画作在台北大可为画廊举办“杜衡情怀——朱军海峡两岸绘画作品展”。
2016年6月3日，北京保利2016春季拍卖会在京举槌。在下午的“中国当代水墨”专场中，央视主持人朱军的水墨画《牧羊女》拍出130万元。
个人奖项
朱军是勤奋和敬业的，在中央电视台工作的时间里，取得了许多成绩。经过多年的“打磨”，他的主持风格日渐成熟。台下的他比印象中电视荧屏上黑瘦。黑，是健康的黑；瘦，是精干的瘦。在《人生课堂》节目中，他的主持风格以及着装、语言，都与《艺术人生》不同，更加轻松活泼、接地气。
朱军为了让自己的形象接地气，在台上自黑。在《星光大道》节目现场，他习惯性地在每个选手表演结束之后抛出一个深沉的主题。为了迎合观众让观众开心，他不仅频繁展示歌艺，还把自己不擅长的部分也展示在观众面前，逗乐了很多观众。